La docencia en el ICOF se realiza a tres niveles:

Varios profesionales del ICOF imparten clases en el Grado de Medicina. Los alumnos de 5º curso de la Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud de la UB realizan sus prácticas en las instalaciones del ICOF y del Hospital Sagrat Cor. Además, desarrollan su trabajo de fin de grado tutorizados por profesores del ICOF y también estancias formativas de ocho semanas durante el 6º curso del grado.

El ICOF recibe cada año cuatro médicos para completar su programa formativo en la especialidad de: 

El programa del ICOF es de los de más prestigio del Estado y año tras año se trabaja en su mejora.

Se organizan distintas formaciones dirigidas a profesionales. Hay una sesión semanal general del Instituto y varias sesiones de las diferentes subespecialidades. Por otra parte, el ICOF organiza un plan de formación continuada a través de Aula Clínic, que crecerá en los próximos años con la construcción de la nueva área quirúrgica, con una zona de wet lab.