El Dr. Bernardo desenvolupa la seva tasca assistencial a l'Hospital Clínic de Barcelona, com a consultor Sènior del Servei de Psiquiatria i cap de la Unitat d'Esquizofrènia Clínic, va ser president de la Societat Espanyola de Psiquiatria Biològica (2012-2016) i actualment és President de la Fundació Espanyola de Psiquiatria i Salut Mental (FEPSM).
La línia d'investigació del Dr. Bernardo està centrada en esquizofrènia, a les següents àrees: Primers episodis psicòtics i fases primerenques de la malaltia; Salut física i estils de vida; Biomarcadors, psiquiatria translacional i de precisió; Neuropsi-cologia, intervencions psicològiques i avaluació psicomètrica; Neuropsicofarmacologia i tractaments biològics. Autor de 306 articles en revistes científiques, ha dirigit 25 tesis doctorals, ha publicat 15 llibres i ha escrit 75 capítols de llibre
Ha estat Cap de l'equip de Bases Bio0lògiques del trastorn psíquic i psiquiatria nuclear de l'IDIBAPS des de la creació d'aquest Institut. És Coordinador del Grup Esquizofrènia Clínic (GEC), reconegut com a Grup Consolidat de Recerca des de la seva creació per l'Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca de la Generalitat de Catalunya i Coordinador del Grup Esquizofrènia Clínic de l'Institut de Neurociències de l'Universitat de Barcelona. També és Investigador principal del grup G04 del programa d'Esquizofrènia de CIBERSAM i va ser responsable de relacions institucionals (2011-2014).
Ha obtingut premis rellevants com el Premi de l'Institut d'Estudis Catalans, Premi d'Investigació Biomèdica August Pi-Sunyer per la seva trajectòria científica, Premi Best in Class a la millor Unitat d'Esquizofrènia del Servei Nacional de Salut i Premi a l'Excel·lència Professional 2017 a la categoria d'Educació Mèdica, pel Col·legi Oficial de Metges de Barcelona.