Recerca

Una tècnica per a la seqüenciació massiva de l'ADN podria ajudar en el diagnòstic de les trombosis venoses esplàcniques

Un estudi coordinat per investigadors de l'Hospital Clínic-IDIBAPS demostra que la tècnica Next Generation Sequencing (NGS), utilitzada per a la seqüenciació massiva de l'ADN, podria ser útil per al maneig de la trombosi venosa esplàcnica (TVE), ja que permet detectar alteracions que no es troben mitjançant tècniques convencionals.

D'esquerra a dreta: Francisco Cervantes, Mónica López, Alberto Álvarez, Dolors Colomer, Juan Carlos García-Pagán i Marta Magaz.

Aquest estudi, publicat al Journal of Hepatology, és el primer que ha utilitzat aquesta tècnica en una cohort àmplia de pacients amb TVE. Ha estat liderat pel Dr. Juan Carlos García-Pagán, cap de el grup Regulació de la microcirculació hepàtica en la cirrosi i malalties vasculars hepàtiques de l'IDIBAPS i investigador del CIBEREHD; pel Dr. Francisco Cervantes cap de el grup Neoplàsies mieloides de l'IDIBAPS i el Dr. Alberto Alvarez, de el mateix grup; i per la Dra. Dolors Colomer, cap de el grup Teràpies experimentals en neoplàsies limfoides de l'IDIBAPS i membre del CIBERONC. Marta Magaz, investigadora predoctoral del grup que dirigeix ​​el Dr. García-Pagán, és la primera signant de l'article.

El terme Trombosi venosa esplàcnica no cirròtica i no tumoral (TVE) engloba les malalties conegudes com a síndrome de Budd-Chiari (SBC) i trombosi portal no cirròtica. La causa més freqüent subjacent en ambdues malalties són les neoplàsies mieloproliferatives (NMP). No obstant això, en fins a un 30% de pacients amb TVE, no es troba cap causa subjacent i es consideren d'origen idiopàtic. "La nostra hipòtesi es basa en el fet que una proporció d'aquests pacients" idiopàtics" podrien tenir una NMP/clonalitat hematopoètica no diagnosticada per les tècniques convencionals emprades en l'actualitat", assenyala el Dr. García-Pagán, coordinador de l'estudi.

La identificació de mutacions hematològiques clàssiques com el JAK2V617F o la calreticulina (CALR) van representar un important progrés en el diagnòstic de les TVE, però, alguns pacients amb NMP presenten negativitat per aquestes mutacions, sent necessari per al seu diagnòstic la biòpsia de medul·la òssia.

La tècnica de Next Generation Sequencing (NGS) permet realitzar l'anàlisi de seqüenciació massiva de l'ADN, sent capaç d'analitzar simultàniament milions de fragments amb una alta sensibilitat fins i tot amb una càrrega mutacional molt baixa.

L'objectiu de l'estudi publicat al Journal of Hepatology va consistir en avaluar el paper de les tècniques de NGS en el diagnòstic etiològic de TVE en què no s'havia identificat, després d'un estudi exhaustiu per tècniques convencionals, cap factor protrombòtic.

En aquest treball s'ha analitzat mitjançant un panell de NGS (Sophia Genetics Myeloid Tumor Solution Panel®), l'ADN de 75 pacients amb TVE idiopàtiques/exclusiu factor local aïllat i de 5 pacients amb una NMP diagnosticada per biòpsia medul·lar. En cap d'aquests pacients s'havien detectat per les tècniques moleculars clàssiques les mutacions característiques de les MPN, com són les mutacions de JAK2 (V617F i en el Exon 12), de CALR o de MPL.

La tècnica NGS va permetre detectar 3 pacients amb mutació en el exon 12 de JAK2 amb nivells mutacionals per sota del 10%, que no era possible detectar mitjançant les tècniques de seqüenciació convencionals. A més d'aquestes mutacions clàssiques, NGS va detectar, en un terç dels pacients, mutacions en altres gens com ASXL1, DNMT3A i TET2, que s'han agrupat recentment amb el terme de "CHIP" (de les seves sigles en anglès clonal hematopoyesis of Indeterminate potential) i que s'han relacionat amb patologia mieloide i/o estats proinflamatoris. "A més, cal esmentar que aquells pacients portadors d'aquestes mutacions van presentar un major risc de desenvolupar un nou episodi de trombosi esplácnica durant el seguiment", apunta Marta Magaz.

Així, l'estudi conclou que la tècnica NGS podria ser útil per millorar el diagnòstic de les trombosis venoses esplácniques i el maneig dels pacients amb la malaltia.

Referència de l'article:

Next generation sequencing in the diagnosis of non-cirrhotic splanchnic vein thrombosis.
Magaz M, Alvarez-Larrán A, Colomer D, López-Guerra M, García-Criado MÁ, Mezzano G, Belmonte E, Olivas P, Soy G, Cervantes F, Darnell A, Ferrusquía-Acosta J, Baiges A, Turon F, Hernández-Gea V, García-Pagán JC.
J Hepatol. 2020 Jul 14:S0168-8278(20)30456-6. doi: 10.1016/j.jhep.2020.06.045