Recerca

La plataforma de genòmica funcional amplia la capacitat de seqüenciació amb la incorporació del nou NextSeq2000

La nova tecnologia permetrà als investigadors realitzar estudis més grans, amb més mostres, de manera ràpida i més profunditat de seqüenciació amb un cost menor.

El NextSeq2000 és un seqüenciador d’alt rendiment i versatilitat

La Plataforma de Genòmica Funcional de l’IDIBAPS ha incorporat un NextSeq2000, el nou seqüenciador de Next Generation Sequencing (NGS) de la casa Illumina.

El 2013 la plataforma va adquirir un seqüenciador MiSeq amb el que s’han fet més de 500 anàlisis genètiques, de més de 20 projectes d'investigadors de la institució. Bàsicament s’han fet estudis de targeted panels, de cerca de gens concrets, i d'anàlisis del microbioma. Amb la incorporació del nou seqüenciador la plataforma ha augmentat de manera molt significativa la capacitat de seqüenciació i és totalment compatible amb el seqüenciador MiSeq que actualment hi ha.

El NextSeq2000 és un seqüenciador d’alt rendiment i versatilitat que permet seqüenciar fins a 150 parells de bases en anàlisis de les denominades paired-end i genera des de 400 fins a 1100 milions de lectures en una sola carrera.
 
Aquesta gran capacitat fa que sigui un sistema ideal per realitzar estudis d’exoma (WES), RNA-Seq (stranded mRNA i total RNA), càrrega mutacional, targeted panels (custom i predissenyats), microbioma, ChIP-Seq i altres aplicacions a un cost altament competitiu.
 

Plataforma de Genòmica
Anna Enjuanes (anna.enjuanes@idibaps.org)
Plataforma de Genòmica (genomica.idibaps@idibaps.org)
Ext. 2184