Pronòstic del Chagas

El 60% de les persones amb infecció per T. cruzi mai desenvolupen símptomes i quan en tenen (principalment afeccions cardíaques i gastrointestinals) triguen anys a manifestar-se. Per a això, la seva transmissió passa moltes vegades desapercebuda. 

Sense diagnòstic ni tractament, el 30-40% de les persones amb infecció desenvolupen complicacions digestives, les quals són severes en la meitat dels casos. En el cas d'afectar el sistema cardíac, per exemple produint arrítmies, els pacients poden requerir a més del tractament mèdic, de la implantació de desfibril·lador o de marcapassos. Si l'afectació és del múscul cardíac (miocardi), pot requerir-se el trasplantament cardíac en estadis avançats.  

En relació amb les complicacions digestives, si bé no s'associen a una mortalitat superior, sí que ho fan a una morbiditat important (estat de mala salut o discapacitat). Es poden associar als estats avançats de la malaltia episodis de restrenyiment i alteracions nutricionals que només es poden resoldre amb intervencions quirúrgiques.